人体用途
人类和其他动物的胃壁上有一种的腺体，能把吃下去的食盐变成盐酸。盐酸是胃液的一种成分（浓度约为0.5%），它能使胃液保持激活胃蛋白酶所需要的适合的pH值，它还能使食盐中的蛋白质变性而易于水解，以及随食物进入胃里的细菌的作用。此外，盐酸进入小肠后，可胰液、肠液的分泌以及胆汁的分泌和排放，酸性环境还有助于小肠内铁和钙的吸收。
日常用途
制取洁厕灵、除锈剂等日用品。
工业用途
南昌盐酸是一种无机强酸，在工业加工中有着广泛的应用，例如金属的精炼。盐酸往往能够决定产品的质量。
分析化学
在分析化学中，用酸来测定碱的浓度时，一般都用盐酸来滴定。用强酸滴定可使终点更明显，从而得到的结果更确。在1标准大气压下，20.2%的盐酸可组成恒沸溶液，常用作气压下定量分析中的基准物。其恒沸时的浓度会随着气压的改变而改变。